From: Unrooted unordered homeomorphic subtree alignment of RNA trees
Type | UPI | BP | HP | IL | ML | EXT |
---|---|---|---|---|---|---|
UPI | Sequence alignment | ∞ | ∞ | ∞ | ∞ | ∞ |
BP | ∞ | Base-pair alignment | ∞ | ∞ | ∞ | ∞ |
HP | ∞ | ∞ | -10 | 0 | 0 | 0 |
IL | ∞ | ∞ | 0 | -5 | ∞ | ∞ |
ML | ∞ | ∞ | 0 | ∞ | -7 | -7 |
EXT | ∞ | ∞ | 0 | ∞ | -7 | -10 |