| Φ DNA (1 ×) | Φ DNA (100 ×) | Φ DNA (1000 ×) | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Time | Memory | Avg SPS | Time | Memory (GB) | Avg SPS | Time | Memory (GB) | Avg SPS | |
MUSCLE | 45 m 23 s | ~ 8 GB | 0.951 | – | – | – | – | – | – |
MAFFT | 1 m 20 s | ~ 100 MB | 0.926 | 13 m 21 s | ~ 8 | 0.926 | – | – | – |
Clustal-Omega | 1 h 25 m | ~ 3 GB | 0.913 | 15 h 56 m | ~ 30 | 0.913 | – | – | – |
HAlign | 2Â m 12Â s | ~Â 300Â MB | 0.722 | 26Â m 35Â s | ~Â 8 | 0.722 | 5Â h 28Â m | ~Â 40 | 0.722 |
HAlign-II | 14Â s | ~Â 100Â MB | 0.723 | 10Â m 24Â s | ~Â 2 | 0.723 | 1Â h 25Â m | ~Â 15 | 0.723 |